Si querés saber de qué bando estaba Snape, te voy a contar, pero te aviso que la respuesta va a contener mucho spoiler del séptimo libro...

Si se miran los hechos superficialmente, Snape tiene todas las cartas puestas totalmente sobre el bando de los mortífagos: Ayuda a Malfoy, hace el juramento inquebrantable, pasa información confidencial a Voldemort y, ensima, asesina al único mago que impedía a Voldemort tomar el mundo mágico: Dumbledore.
Durante todo el séptimo libro Harry jura vengarse de su ex profesor, y desea encontrárselo para pelear con él, sin embargo Snape sostiene un personaje, al que solo Dumbledore conocía en profunididad, que no se revela hasta el final.
De niño Snape había conocido a una muchacha y se habían hecho amigos. Sin embargo, el chico se enamoró de ella con el correr de los años. Esa chica era Lily, la madre de Harry. Ambos fueron juntos a Hogwarts, pero ella estaba en Gryffindor y él en Slytherin. Primero estuvieron separados por las casas, pero siguieron siendo amigos. Mientras pasaban los años, Lily fue alejándose de Snape, pues el chico había hecho amigos en su casa que eran mortífagos declarados. Además, comenzó a adqurir costumbres dignas de los Slytherin, como por ejemplo, ridiculizar a los sangre impuras. Lily no soportó el cambio de su amigo, por lo que ambos rompieron con su amistad.
Snape en el colegio tenía un enemigo declarado: James Potter. Odiaba al chico más que a nadie, por que este tenía todo lo que él más quería: popularidad, habilidad para el quidditch y buenas calificaciones. Además, James siempre se encargaba de ridiculizar a Snape delante de todos. Este terminó de odiarlo cuando ocurrió algo que no esperaba: Lily comenzó a salir con él.
Con el tiempo, Snape se unió a los mortífagos y Lily y James a la Orden del Fénix. Eran enemigos declarados. Pero el chico aún la amaba.
Un día, Snape escuchó el principio de una profecía que decía que un niño iba a nacer a finales de Julio e iba a ser el elegido para derrotar a Voldemort. Sin dudarlo y sin saber que la profecía tenía un final, se la contó a Voldemort. Lo que Snape no imaginaba era que el niño al que se refería era al hijo de Lily, por lo que su amo querría matar a la familia entera para estar seguro. Le pidió a Voldemort que no matara a Lily, le dijo que no le importaba lo que le hiciera a James y a Harry, pero que a Lily la dejara viva. Pero Snape no confió en que Voldemort le hiciera caso, por lo que recurrió a Dumbledore. Snape prometió estar a sus servicios si él salvaba a la familia.
Como se sabe, Voldemort mató a Lily y a James, pero Harry vivió. Snape se sintió culpable cuando se enteró que la persona a la que amaba había muerto. Dumbledore le dijo que si se sentía así, aún podía remediarlo: Snape de esa forma entró a trabajar como profesor de pociones a Hogwarts, con el fin de proteger a Harry cuando este estuviera allí.
En el momento en que Harry pisó el castillo, Snape no pudo sentir un gran odio hacia él, pues era físicamente parecido a su padre, pero no se podía negar que era igual a Lily en carácter y personalidad, además de en sus ojos. Snape no quería que Harry se enterara jamás que él lo estaba protegiendo, pues no podría soportar admitir ante él que en el fondo le tenía aprecio.
Durante el verano en el que el ministerio por fin había aceptado la vuelta de Voldemort, Dumbledore cae ante la maldición del anillo de Tom Riddle (el horcrux) y Snape le da la noticia de que solo le queda un año de vida, con suerte.
Para ese entonces, tanto Snape como Dumbledore sabían que Draco Malfoy tenía como misión asesinar al director. Pero también eran concientes de que Voldemort había enviado al chico con la convicción de que este iba a fallar y eso iba a darle una excusa para matar a todos los Malfoy. Es por eso que Dumbledore le pide a Snape que en el momento adecuado le haga un favor: debe ser él quién lo asesine.
Snape se niega al principio, pero finalemente promete que lo hará. Dumbledore, además, le da varias razones para hacerlo, entre ellas la de proteger a un chico inocente (Malfoy) y la de terminar de asegurarse así la confianza de Voldemort. También le recuerda como argumento para hacerlo que, si no lo mata él, la maldición que se extiende por su cuerpo lo va a ser lenta y dolorosamente.
Snape obedece a Dumbledore, quedando ante la Orden como el traidor y frente a los mortífagos como el fiel e incondicional vasallo. Pero Snape usa su posición como mano derecha de Voldemort para proteger y ayudar a Harry desde las sombras. También se queda en Hogwarts como director, con el propósito de vigilar que los mortífagos no dañen a los estudiantes.
Fuente (s):
Por más que Voldemort lo considera su mano derecha, casi al final de la historia, ordena a su serpiente que lo mate, pues cree que debe hacer un "sacrificio" para que se ponga en marcha cierto tipo de magia que necesita para enfrentarse a Harry (ese "tipo de magia" es parte importante de la trama del último libro, pero no voy a explicar acá de qué se trata, por que es largo y complicado) El chico observa desde la sombra cómo Snape es asesinado, y en el momento en que Voldemort y Nagini (la serpiente) dejan el lugar donde se encuentra el profesor, se acerca. Snape, con sus úlltimas fuerzas, le entrega a Harry sin explicaciones un frasco lleno de recuerdos y luego muere.
Mirando esos recuerdos es como Harry se entera de todo lo que te conté, y cambia radicalmente su opinión sobre él, hasta el punto de ponerle a uno de sus hijos como segundo nombre "Severus".

Particularmente, creo que la historia de Snape es la mejor de todas... Por que es el único personaje que uno odia hasta los últimos capítulos del último libro, pero sobre el final cambia radicalemente su postura sobre él.
Rowling con Snape realmente logró crear un personaje totalmente complejo y más que interesante.

Cualquier duda, estoy para responder. Ah!! Perdón por la extensión